El Museo empezó a constituirse en 1859, a partir de los ejemplares recogidos en los trabajos de las Comisiones Geológicas y, posteriormente, de los Servicios Geológicos de Portugal y del Instituto Geológico y Minero. La recogida de estas muestras (fósiles, rocas, minerales y objetos arqueológicos), se debe, en gran parte, a los pioneros de la geología portuguesa: Carlos Ribeiro, Nery Delgado, Pereira da Costa y Paul Choffat, entre otros. En la actualidad, estas muestras se han convertido en colecciones de referencia al servicio de la comunidad científica, consultadas constantemente por investigadores nacionales y extranjeros. De este modo, se ubica en el lugar donde tuvieron origen la geología y la arqueología portuguesas, lo que le confiere un valor extraordinario en el contexto de la historia de la ciencia nacional. La disposición de las colecciones, su mobiliario de exposición y la arquitectura interior reflejan, en gran medida, el tipo de museología del siglo XIX, del que ya no se encuentran muchos ejemplares en Europa, por lo que los especialistas lo consideran un «museo de museos». Al mismo tiempo que se mantenían estas características, se ha procurado actualizar la exposición y mejorar sus aspectos pedagógicos, centrándose también en los alumnos de las escuelas y el público no especialista.
El Museo Geológico comenzó a formarse alrededor de 1859, a partir de muestras recogidas en el trabajo de la Comisión Geológica y, posteriormente, del Instituto Geológico y Minero de Portugal y el Instituto Geológico y Minero. La recogida de ...